Лесото е единствената държава в света, чиято територия изцяло се намира на над 1400 метра надморска височина.

Лесото е обхванато от планинските вериги Малоти и Драконови планини. Повече от 80% от страната се намира над 1800 метра височина. Най-високият ѝ връх е Табана Нтленяна, който достига 3482 метра – най-високата точка в цяла Южна Африка.Голямата надморска височина прави климата в Лесото много по-студен от този в околните райони. Снеговалежите са често срещани през зимните месеци от юни до август. Поради студеното време и снега, в Лесото се намира единственият ски курорт в Субсахарска Африка. Високопланинският релеф поддържа растителни и животински видове, които не се срещат никъде другаде на континента.Планините са служили като естествена крепост за народа басуто по време на войните през XIX век. Днес голяма част от територията все още е труднодостъпна с автомобил, затова много хора използват местното пони басуто за придвижване по скалистия терен.Земята се е формирала преди милиони години от дебели слоеве лава. С течение на времето водата и вятърът са изваяли скалите в дълбоки долини и плоски плата. Лесото действа като „водна кула“ за региона, доставяйки вода на Южна Африка чрез мащабна система от язовири и тунели.