Юпитер се върти по-бързо от всяка друга планета в Слънчевата система, като едно пълно завъртане около оста му отнема по-малко от 10 часа.

На Юпитер са му необходими само 9 часа, 55 минути и 30 секунди за едно пълно завъртане. Тази висока скорост създава центробежна сила, която изтласква материята в средната част на планетата навън. Поради това диаметърът на Юпитер при екватора е с около 9275 км по-голям от разстоянието между полюсите му. Учените наричат тази форма сплеснат сфероид.Бързата ротация управлява и метеорологичните условия на планетата. Тя създава силни ветрове, които се движат в противоположни посоки, формирайки характерните цветни ивици, които виждаме на снимките. Тези ветрове достигат дълбоко в атмосферата – на около 3000 км под облаците. Космическият апарат „Джуно“ на НАСА откри тези дълбоки ветрови модели след пристигането си при планетата през 2016 г.Въртенето на Юпитер спомага и за създаването на масивно магнитно поле, което е 14 пъти по-силно от земното. То се генерира от течен метален водород, намиращ се дълбоко във вътрешността, който действа като гигантско динамо при въртенето на планетата.Юпитер поддържа тази скорост от самото си зараждане преди около 4,5 милиарда години. Ако планетата се въртеше значително по-бързо, центробежните сили биха били достатъчно мощни, за да я разрушат.